Sequence Alignments With Human Germline Genes


Mouse CD3 Antibody (OKT3)

[Full Results]

Mouse VH Compared with Human DP-7_21-2-.. and JH6a

               10        20        30        40        50        60        70        80        90       100       110      119
OKT3H  QVQLQQSGAELARPGASVKMSCKASGYTFTRYTMHWVKQRPGQGLEWIGYINPSRGYTNYNQKFKDKATLTTDKSSSTAYMQLSSLTSEDSAVYYCARYYDDHYCLDYWGQGTTLTVSS
       :::: :::::. .::::::.:::::::::: : ::::.: :::::::.: :::: : :.: :::. ..:.: : :.::.::.:::: :::.::::::: :  .: .: ::::::.::::
DP-7_2 QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYMHWVRQAPGQGLEWMGIINPSGGSTSYAQKFQGRVTMTRDTSTSTVYMELSSLRSEDTAVYYCAR YYYYYGMDVWGQGTTVTVSS JH6a



Humanised CD3 Antibody (OKT3)

[Full Results]

Humanised VH Compared with Human b25 and JH6a

               10        20        30        40        50        60        70        80        90       100       110      119        
OKT3Hh QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCKASGFIFSRYTMHWVRQAPGKGLEWIGYINPSRGYTNYNQKFKDRFTISTDKSKSTAYLQMDSLRPEDTAVYYCARYYDDHYCLDYWGQGTTLTVSS
       :::::::::::::::::::::: :::: :: :.::::::::::::::.. :. . .   :... : ::::: :.::.: ::::.::: :::::::::: :  .: .: ::::::.::::
b25    QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFSSYAMHWVRQAPGKGLEWVAVISYDGSNKYYTDSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAR YYYYYGMDVWGQGTTVTVSS JH6a



Mouse CD19 Antibody (HD37)

[Full Results]

Mouse VH Compared with Human 6M27 and JH4D

               10        20        30        40        50        60        70        80        90       100       110       120
HD37H  QVQLQQSGAELVRPGSSVKISCKASGYAFSSYWMNWVKQRPGQGLEWIGQIWPGDGDTNYNGKFKGKATLTADESSSTAYMQLSSLASEDSAVYFCARRETTTVGRYYYAMDYWGQGTSVTVSS
       :::: :::::. .::::::.:::::: .:::: ..::.: :::::::.:.: :  : .::  ::.:..:.:::::.:::::.:::: :::.:::.:::        :::.:: :::::.:::::
6M27   QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFSSYAISWVRQAPGQGLEWMGRIIPILGTANYAQKFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR        YYYGMDVWGQGTTVTVSS JH4D

Mouse VK Compared with Human DPK9_O12- and JK2

               10        20        30        40        50        60        70        80        90       100        
HD37L  DILITQSPKSMSMSVGERVTLTCKASENVVTYVSWYQQKPEQSPKLLIYGASNRYTGVPDRFTGSGSATDFTLTISSVQAEDLADYHCGQGYSYPYTFGGGTKLEIK
       :: .::::.:.: :::.:::.::.::... .:..:::::: ..::::::.::.  .:::.::.::::.:::::::::.: ::.: :.: :.:: ::::: :::::::
DPK9_O DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYSTPYTFGQGTKLEIK JK2



Chimeric CD20 Antibody

[Full Results]

Mouse VH Compared with Human VH DP-7_21-2- and JH2

               10        20        30        40        50        60        70        80        90       100       110       120
CD20h  QAYLQQSGAELVRPGASVKMSCKASGYTFTSYNMHWVKQTPRQGLEWIGAIYPGNGDTSYNQKFKGKATLTVDKSSSTAYMQLSSLTSEDSAVYFCARVVYYSNSYWYFDVWGTGTTVTVS
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DP-7_2 QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYMHWVRQAPGQGLEWMGIINPSGGSTSYAQKFQGRVTMTRDTSTSTVYMELSSLRSEDTAVYYCAR       YWYFDLWGRGTLVTVS JH2


Mouse VK Compared with Human VK VG_38K- and JK2

               10        20         30        40        50        60        70        80        90       100 
CD20l  QIVLSQSPAILSASPGEKVTMTCRASSSV-SYMHWYQQKPGSSPKPWIYAPSNLASGVPARFSGSGSGTSYSLTISRVEAEDAATYYCQQWSFNPPTFGAGTKLELK
       .:::.:::: :: ::::..:..::::.:: ::. :::::::..:.  ::  :: :.:.:::::::::::...:::: .: :: :.::::: :  : ::: :::::.:
VG_38K EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYDASNRATGIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQRSNWPYTFGQGTKLEIK JK2


Humanised CD25 antibody anti-TAC

[Full Results]

Humanised V-region against human V-segment HV1F10T and JH6a

               10        20        30        40        50        60        70        80        90       100       110      
TacHh  QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFTSYRMHWVRQAPGQGLEWIGYINPSTGYTEYNQKFKDKATITADESTNTAYMELSSLRSEDTAVYYCARGGGVFDYWGQGTTLTVSS
       :::::::::::::::.:::::::::::::::: ::::::::::::::.: :::: : : : :::. ..:.: : ::.:.:::::::::::::::::::     : ::::::.::::
hv1f10 QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYMHWVRQAPGQGLEWMGIINPSGGSTSYAQKFQGRVTMTRDTSTSTVYMELSSLRSEDTAVYYCAR     DVWGQGTTVTVSS JH6a


Mouse CD25 antibody anti-TAC

[Full Results]

Mouse V-region against human V-segment HV1F10T and JH4D

               10        20        30        40        50        60        70        80        90       100       110      
aTacH  QVQLQQSGAELAKPGASVKMSCKASGYTFTSYRMHWVKQRPGQGLEWIGYINPSTGYTEYNQKFKDKATLTADKSSSTAYMQLSSLTFEDSAVYYCARGGGVFDYWGQGTTLTVSS
       :::: :::::. :::::::.:::::::::::: ::::.: :::::::.: :::: : : : :::. ..:.: : :.::.::.::::  ::.:::::::    :::::::: .::::
HV1F10 QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYMHWVRQAPGQGLEWMGIINPSGGSTSYAQKFQGRVTMTRDTSTSTVYMELSSLRSEDTAVYYCAR    FDYWGQGTLVTVSS JH4D

Mouse VK against human VK segment DPK26_A26- and JK4

               10        20         30        40        50        60        70        80        90       100      
aTacL  QIVLTQSPAIMSASPGEKVTITCSASSSI-SYMHWFQQKPGTSPKLWIYTTSNLASGVPARFSGSGSGTSYSLTISRMEAEDAATYYCHQRSTYPLTFGSGTKLELK
       .::::::: ..:..: ::::::: ::.:: : .::.::::  :::: :  .:.  ::::.:::::::::...:::. .:::::::::::: :. :::::.:::.:.:
DPK26_ EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITCRASQSIGSSLHWYQQKPDQSPKLLIKYASQSFSGVPSRFSGSGSGTDFTLTINSLEAEDAATYYCHQSSSLPLTFGGGTKVEIK JK4

Humanised CD52 Antibody Campath-1H

[Full Results]

Humanised VH Compared with Human VH DP-71_3D197D- and JH4D

               10        20        30        40        50        60        70        80        90       100       110       120
cp1hh  QVQLQESGPGLVRPSQTLSLTCTVSGFTFTDFYMNWVRQPPGRGLEWIGFIRDKAKGYTTEYNPSVKGRVTMLVDTSKNQFSLRLSSVTAADTAVYYCAREGHTAAPFDYWGQGSLVTVSS
       ::::::::::::.::.:::::::::: .....: .:.:::::.::::::.:  ..   .:.::::.:.:::. ::::::::::.::::::::::::::::       :::::::.::::::
DP-71_ QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGGSISSYYWSWIRQPPGKGLEWIGYIYYSG---STNYNPSLKSRVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCAR       FDYWGQGTLVTVSS JH4D


Humanised VL compared with DPK1_018- and JK

               10        20        30        40        50        60        70        80        90       100       
cp1hl  DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQNIDKYLNWYQQKPGKAPKLLIYNTNNLQTGVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYYCLQHISRPRTFGQGTKVEIK
       :::::::::::::::::::::::.:::.:..::::::::::::::::::...::.::::::::::::::::::::::::::::::::: :. . : ::::::::::: 
DPK1_O DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCQASQDISNYLNWYQQKPGKAPKLLIYDASNLETGVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYYCQQYDNLPWTFGQGTKVEIK JK1

Rat CD52 Antibody Campath-1G

[Full Results]

Rat VH Compared with Human VH DP-34_DA-10 and JH4D

               10        20        30        40        50        60        70        80        90       100       110       120
cp1gh  EVKLLESGGGLVQPGGSMRLSCAGSGFTFTDFYMNWIRQPAGKAPEWLGFIRDKAKGYTTEYNPSVKGRFTISRDNTQNMLYLQMNTLRAEDTATYYCAREGHTAAPFDYWGQGVMVTVSS
       ::.:.::::::::::::.:::::.:::::.:.::.:.::  ::. ::.::::.::.: ::: . :::::::::::..... :::::.:::::::.:::::       :::::::..:::::
DP-34_ EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSDYYMSWVRQAPGKGLEWVGFIRNKANGGTTEXTTSVKGRFTISRDDSKSITYLQMNSLRAEDTAVYYCAR       FDYWGQGTLVTVSS JH4D


Rat VL compared with DPK9_012- and JK2

               10        20        30        40        50        60        70        80        90       100        
cp1gl  DIKMTQSPSFLSASVGDRVTLNCKASQNIDKYLNWYQQKLGESPKLLIYNTNNLQTGIPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDVATYFCLQHISRPRTFGTGTKLELK
       ::.:::::: ::::::::::..:.:::.:..:::::::: :..:::::: ...::.:.:::::::::::::::::::::::: :::.: :  : : ::: :::::.:
DPK9_O DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYSTPYTFGQGTKLEIK JK2     


Human RhD antibody FOG-1

[Full Results]

Human Heavy Chain V-region against human VH segment V4-34 and JH6A

               10        20        30        40        50        60        70        80        90       100       110       120
fog1vh QVHLQQWGTGLLKPSETLSLTCAVHGGSFNVYYWTWIRQPPGKALEWIGEINHSGGANYNPSLKSRVTMSADTSKNQFSLKLTSVTAADTAVFYCARGRSRYSGYGFYSGMDVWGPGTTVTVSS
       ::.:::::.:::::::::::::::.::::. :::.::::::::.:::::::::::..:::::::::::.:.:::::::::::.:::::::::.::::       : .: :::::: ::::::::
V4-34  QVQLQQWGAGLLKPSETLSLTCAVYGGSFSGYYWSWIRQPPGKGLEWIGEINHSGSTNYNPSLKSRVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCAR       YYYYYGMDVWGQGTTVTVSS JH6A


Human Light Chain V-region against human VK segment A30_SG3 and JK2

               10        20        30        40        50        60        70        80        90       100        
fog1vk DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQVIRNDLVWFQQKPGIAPKRLIYAASSLQSGVPSRFSGSGFGTEFTLTISSLQPEDFATYYCLQHFSYPYTFGQGTKLEIK
       ::::::::::::::::::::::::::: ::::: :.::::: :::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
A30_SG DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQGIRNDLGWYQQKPGKAPKRLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYCLQHNSYPYTFGQGTKLEIK


Mouse TNF-alpha antibody

[Full Results]

Mouse Heavy Chain V-region against human VH segment VI-4-IB and JH3B

               10        20        30        40        50        60        70        80        90       100       110       
TNFalp QIQLVQSGPELKKPGETVKISCKASGYTFTHYGMNWVKQAPGKGLKWMGWINTYTGEPTYADDFKEHFAFSLETSASTVFLQINNLKNEDTATYFCARERGDAMDYWGQGTSVTVSS
       :.:::::: :::::: .::.:::::::::: :.::::.::::.::.::::::: ::.::::. :  .:.:::.::.::..:::..:: ::::.:.:::   ::.: ::::: :::::
VI-4-1 QVQLVQSGSELKKPGASVKVSCKASGYTFTSYAMNWVRQAPGQGLEWMGWINTNTGNPTYAQGFTGRFVFSLDTSVSTAYLQISSLKAEDTAVYYCAR   DAFDIWGQGTMVTVSS


Mouse Light Chain V-region against human VK segment L10A and JK4

               10        20        30         40        50        60        70        80        90       100        
TNFalp SIVMTQTPKFLLVSAGDRVTITCTASQSVSNDVV-WYQQKPGQSPKMLMYSAFNRYTGVPDRFTGRGYGTDFTFTISSVQAEDLAVYFCQQDYNSPRTFGGGTKLEIK
        :::::.:  : .: :.:::..: ::::::.. . ::::::::.:..:.:.: .: ::.: ::.: : :::::.::::.: ::.:::.:::::: : :::::::.:::
L10A   EIVMTQSPPTLSLSPGERVTLSCRASQSVSSSYLSWYQQKPGQAPRLLIYGASTRATGIPARFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFAVYYCQQDYNLPLTFGGGTKVEIK


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© Mike Clark, PhD., Cambridge University, UK
Last updated on 18th October 2001